Юко Ґото

Після того, як Мадока переписала всесвіт, пожертвувавши собою та своїми щасливими звичайними днями, щоб врятувати всіх дівчат-чарівниць від жорстокої долі, яка чекала на них, відчай все ще проявляється в створіннях, відомих як кошмари. Дівчина-чарівниця Хомура Акемі продовжує битися сама в надії, що вона знову зможе побачити посмішку Мадоки.

Фільм є продовженням телесеріалу «Меланхолія Харухі Судзумії», з сюжетом якого тісно пов'язаний. За сюжетом «Зникнення», Кьон — член шкільного гуртка «Команда SOS», організованого Харухі, — в один грудневий день виявляє, що світ за ніч повністю змінився: зокрема, гуртка більше не існує, і інші учасники його не впізнають.