Johnny A. Sanchez

天才的なギターの才能を持つ少年ミゲルはミュージシャンを夢見ているが、過去の悲しい出来事が原因で、彼の一族には音楽禁止の掟が定められていた。ある日ミゲルは、憧れの伝説的ミュージシャン、デラクルスの霊廟に飾られていたギターを手にしたことをきっかけに、まるでテーマパークのように楽しく美しい「死者の国」へ。ミゲルはガイコツのヘクターに協力してもらい、元の世界へ戻る方法を探る。

南極にある皇帝ペンギンの国“エンペラー帝国”。彼らにとって何より大事なことは、自分だけの“心の歌”を見つけること。ところがマンブルは筋金入りの音痴で、小学校では幼なじみのグローリアが美声を披露するのとは対照的に調子外れな音程で大非難を浴びる始末。その代わり生まれつきタップダンスが得意なマンブルは、アデリー・ペンギンの５人組“アミーゴス”に踊りを絶賛され意気投合。しかし、そのダンスが帝国に災いをもたらすと判断した長老の命令でマンブルは追放の身に。さらに、ペンギンの食糧となる魚を乱獲する人間たちを説得しに向かった彼は、挙句に捕らえられてしまう。

南極。皇帝ペンギンのマンブルは《ハッピーフィート》の異名を取るタップダンスの達人として知られていたが、彼の幼い息子エリックはダンスが大の苦手。あるとき、とうとう家出したエリックは、アデリーペンギンの集落で空を飛べる不思議なペンギン、スヴェンと出会う。不可能を可能にしたスヴェンに魅了されるエリック。そんな矢先、氷山の衝突によって皇帝ペンギンの国が陥没し、仲間たちが閉じ込められる大事件が発生する。