في هذا الفيلم تتقاطع حياة طيّارة قوات الدفاع الذاتي اليابانية آكاني مع ظهور جودزيلا جديد في تاتياما، فتتحول المدينة الهادئة إلى ساحة دمار وصراع. المشاهد تعكس توترًا عسكريًا وتقنيًا بينما الفرق تحاول احتواء العملاق بوسائل حديثة، ومع كل مواجهة تتضح عواقب القوة البشرية أمام قوة طبيعية هائلة.
كرد فعل، يُبنَى سلاح ميكانيكي سايبورغي اسمه كيريو من بقايا الوحش الأصلي، ويُكتشف لاحقًا أنه يحمل صدى روح ذلك المخلوق، ما يخلق صراعًا غريبًا بين الآلة والذاكرة. آكاني تجد نفسها مضطرة لإعادة تقييم حياتها وقيمها وهي تشهد صدام الكيريو وجودزيلا، والفيلم يستكشف مواضيع الهوية والضمير والتضحية في زمن تلتقي فيه التكنولوجيا بأسرار الماضي.